Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDP1Q9P0J1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDP1Q9P0J1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms