Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD3Q9NX63 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms