Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYTL1Q9NRR1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms