Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMURF2Q9HAU4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMURF2Q9HAU4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms