Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIFKQ9BYG3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIFKQ9BYG3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms