Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC11CQ9BY50 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEC11CQ9BY50 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms