Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDLIM2Q96JY6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDLIM2Q96JY6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms