Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC136Q96JN2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms