Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCC12Q96J65 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms