Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C6Q969F1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C6Q969F1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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