Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C17orf47Q8NEP4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C17orf47Q8NEP4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms