Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPC24Q8NBT2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms