Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFNL1Q8IU54 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms