Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APTXQ7Z2E3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms