Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00299Q6ZSB3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms