Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms