Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KANK3Q6NY19 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms