Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms