Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ALS2CLQ60I27 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CLQ60I27 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms