Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms