Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q1T7F1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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