Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SQLEQ14534 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SQLEQ14534 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SQLEQ14534 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SQLEQ14534 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms