Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSTA3Q13630 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms