Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE3BQ13370 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE3BQ13370 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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