Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CGNL1Q0VF96 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms