Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TYRO3Q06418 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TYRO3Q06418 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms