Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UFM1P61960 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFM1P61960 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFM1P61960 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFM1P61960 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UFM1P61960 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UFM1P61960 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UFM1P61960 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms