Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAP1L1P55209 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms