Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DAP3P51398 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DAP3P51398 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DAP3P51398 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DAP3P51398 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DAP3P51398 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DAP3P51398 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms