Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASP3P42574 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASP3P42574 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CASP3P42574 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms