Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF4A3P38919 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms