Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCVRNP35243 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms