Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATF1P18846 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATF1P18846 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms