Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGAMP11215 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGAMP11215 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms