Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CT47B1P0C2W7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CT47B1P0C2W7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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