Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ITGAVP06756 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGAVP06756 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms