Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRTO14522 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
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