Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms