Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 PRUNE1-204ENST00000368936 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 VRTN-201ENST00000256362 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM55A-201ENST00000285419 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ERCC5-202ENST00000375954 2986 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AMZ2-205ENST00000577866 1492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CCL22-201ENST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MLC1-202ENST00000395876 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC008543.1-201ENST00000344893 3383 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC008739.5-201ENST00000623035 1938 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PTGER4-201ENST00000302472 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SWT1-201ENST00000367500 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CELF2-212ENST00000632728 3827 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SIMC1-201ENST00000332772 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CALCR-201ENST00000359558 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02452-201ENST00000637833 2982 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 USP32P2-201ENST00000412260 4329 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CEACAM7-201ENST00000006724 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR8G3P-203ENST00000641848 1344 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V0D2-201ENST00000285393 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FAM239B-202ENST00000424415 2194 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SOX13-210ENST00000618875 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL1-201ENST00000377844 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PSG3-204ENST00000595140 1724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC016168.3-201ENST00000625040 3246 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms