Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A3GALT2U3KPV4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
A3GALT2U3KPV4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms