Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC1Q9Y5R8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms