Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC9Q9Y397 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC9Q9Y397 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms