Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALKQ9UM73 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALKQ9UM73 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms