Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms