Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMPXQ9UHP9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMPXQ9UHP9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms