Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOPORSQ9NS56 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms