Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM1Q9NRU3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM1Q9NRU3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms