Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRPEL1Q9HAV7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRPEL1Q9HAV7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms