Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG5Q9H1Y0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms