Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NSD3Q9BZ95 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSD3Q9BZ95 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms